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如何参与医疗软件开源项目

  • 2020-04-15
  • 本文字数:1588 字

    阅读完需:约 5 分钟

如何参与医疗软件开源项目

本文最初发布于 Medium 博客,经原作者授权由 InfoQ 中文站翻译并分享。


作为一名软件开发人员,我觉得我可以产生巨大的影响。在某种程度上,我觉得帮助一家披萨连锁店提高在线销售额或帮助抵押贷款机构提高利润率是一种浪费。随着 COVID-19 大流行的全面爆发,我想要帮助一个与我息息相关的项目。

The OHIF Viewer

The OHIF Viewer是一个开源的、基于 Web 的医学影像查看器。该项目维护的扩展添加了对 2D(切片)和 3D(容积)影像的查看、注解和报告的支持。



病变标记工作流示例(点击这里查看动图)


  • 它是 100%免费和开源的;

  • 它主要用于临床研究和实验;

  • 对于发展中国家来说,这是一个很好的选择(它可以在树莓派上运行);

  • 它有资金来源(不会明天就消失)。

如何提供帮助?

这听起来可能很奇怪,但是请为我们的GitHub库加星,帮助我们获得更多的资金支持。


我们目前的资金仅够资助两位全职开发者至八月。我们正明智地利用这段时间来完成重新设计和核心架构的修改,以提高 OHIF Viewer 的可扩展性,同时加强我们对肿瘤成像研究的开箱即用支持。



我们针对“一般查看”模式的设计草图。


React 组件库


我们有一个遵循原子设计原则的组件库。我们需要帮助创建符合我们设计的 React 组件。它们中的大多数都是“基本的”,组合起来可以创建示例“视图”,用模拟数据和虚假交互演示不同的 UI 状态。我们使用docz组件库(基于Gatsby构建)来实现这一点。您贡献的每个组件、测试和一些文档都非常有助于我们朝着目标前进。


核心架构修改


OHIF Viewer 的第一个实现是一个简单的 Meteor 应用程序,它只有一个用途。虽然它曾经(现在仍然)非常有用,但我们正在适应并支持我们社区的各种用例,使与他人“共享”工作流、特性和功能变得更容易。


几乎所有这些代码都是普通的 JavaScript,不特定于领域。能够编写单元测试、讨论实现和满足规范的开发人员都可以很好地帮助我们。



Freesurfer 分割可视化,使用了 react-vtkjs-viewport(点击这里查看动图)。


影像、分割和三维可视化专业知识


这个类别不太可能适用于大多数人。对前面几项的任何帮助都可以释放我们有限的资源,从而在这些项目上取得更大的进展。如果您有这方面的专业知识,并希望做出贡献,请不要犹豫联系我们,我们可以合作。特别是我们有一个 PET-CT Fusion 和多容积的愿望清单,这需要 WebGL/着色器经验。


额外的资金和资源


虽然我们目前的资助将在 8 月到期,但我们已经申请了延期,将资助 2 名全职开发人员的期限再延长 5 年。如果您有兴趣为关键特性提供资金,或者您想为项目分配开发资源,但不知道如何分配,请联系我们。


下一年度拨款的一些细目:


  • 简化部署和安装;

  • 支持移动分辨率和 Electron 桌面应用程序;

  • 扩展扩展和模式支持;共享“工作流”的目录;

  • 更多。

相关项目

这个领域有很多项目。如果您知道任何优秀的项目是自由许可并且欢迎贡献者,请在评论中列出它们,我会尽力更新这个列表。

EMR/HIS

电子健康记录和健康信息系统。通常,这些系统允许管理和查看病人档案,并且是许多其他系统的共同集成点。例如,您可以使用 EMR 来查找患者的“影像研究”,并在 OHIF Viewer 中启动查看会话。


Hospital Run:https://hospitalrun.io/

医学影像数据存储和检索

在这个类别中有更多的选择。传统上,这些被称为 PACS(影像存档和通信系统)或影像存档。它们保存医学影像数据并公开用于检索和存储的 API。


dicomweb-server:https://github.com/dcmjs-org/dicomweb-server(JS)


DICOMCloud:https://github.com/DICOMcloud/DICOMcloud(C#)


Orthanc:https://www.orthanc-server.com/(C++)


DCM4CHEE:https://www.dcm4che.org/(Java)


联系方式


  • 创建一个 GitHub 问题!

  • 直接联系我:danny.ri.brown@gmail.com


定期贡献者可以收到邀请到我们的合作伙伴 Slack 集团。我们还会与能够投入时间和资源的个人和组织定期举行治理和规划会议。


原文链接:


Get Involved: Open Source Healthcare Software


2020-04-15 09:053262

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