基因组实现自动 AI 建模,华为云助力科研人员探索生命奥秘

阅读数:1 2020 年 3 月 29 日 19:51

基因组实现自动AI建模,华为云助力科研人员探索生命奥秘

目前,AI 技术已经广泛应用在图像、语音等领域,然而在生物医学领域,尤其是基因组学数据领域,AI 的应用仍处于初期阶段。

主要原因是,由于基因组数据的复杂性,导致主流的基于图像和文本的模型不能很好地对基因组数据进行建模;同时,由于 AI 模型的搭建开发门槛较高,需要开发者有比较多的经验。

基因组实现自动AI建模,华为云助力科研人员探索生命奥秘

华为云发布的 AutoGenome,采用了超参数自动搜索、神经网络架构自动搜索和模型自动解释器等最新的 AutoML 技术,并且提出了全新的更加适用于基因组数据建模的残差全连接网络,在多项不同的基因组数据建模任务中,AutoGenome 的准确性都超出传统模型 5 个百分点以上。

在开发过程上,AutoGenome 对于 AI 的初学者非常友好,用户在华为云 ModelArts 一站式 AI 开发管理平台可以一键启动 Notebook 开发环境,只需要五行代码即可快速完成端到端的基因组数据建模、准确性评估和模型结束。

AutoGenome Examples 已经列入华为云 ModelArts Notebook 任务中

此外,华为云还联合华为 2012 实验室媒体院研发了 autosearch 自动化搜索框架并预置在华为云一站式 AI 开发管理平台 ModelArts 中,可以集成更多的 automl 搜索算法,便于支持更多的基因建模能力。

大会期间,中科院基因组所韩大力教授也现场分享了如何利用 AutoGenome 对羟甲基化组学数据进行建模,从而实现对肝癌的诊断。

该案例中,借助 AutoGenome 的自动建模比文献报道的同类工作准确率高出八个百分点。

目前,AutoGenome 已经正式上线,用户可在华为云 ModelArts 一站式 AI 开发管理平台上使用。

本文转载自 华为云产品与解决方案 公众号。

原文链接: https://mp.weixin.qq.com/s/sRzMBJ9zA4OeAd--Cu0fXA

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