【ArchSummit】如何通过AIOps推动可量化的业务价值增长和效率提升?>>> 了解详情
写点什么

Windows Azure 上的 NCBI BLAST

  • 2010-12-18
  • 本文字数:873 字

    阅读完需:约 3 分钟

NCBI BLAST 的全名是“国家生物学信息中心的基本本地排列搜索工具(Basic Local Alignment Search Tool of the National Center for Biotechnology Information)”。 NCBI BLAST 是由工作在国家卫生研究所的一组研究员创建的,那是美国卫生和人类服务部的一个部门。 NCBI 把 BLAST 描述为一种工具,它能够找到序列之间类似的部分。 程序会把核苷酸或者蛋白质的序列与序列数据库相比较,并计算符合的统计学意义。 BLAST 可以被用于推论出序列之间的功能和进化关系,还有助于识别基因家族中的成员。

11 月 6 日,微软宣布他们在Windows Azure 上提供了NCBI BLAST 。 在一个演示中,它们采用了西雅图儿童医院的一个项目来检验已知蛋白质序列的相互关系。 他们声称,如果使用单独的计算机,那么这项分析会花费六年的时间,而Windows Azure 上的NCBI BLAST 完成这项计算只需要一周。 (注意到这里并没有给出“一台计算机”的具体配置。 单独一台超级计算机会比笔记本电脑当然会快得多。) 在另一项演示中,他们为华盛顿大学分析了细菌中的制氢过程。 据微软所说,“当哈佛实验室的本地资源无法处理该项计算时,研究员们把他们的需求提交给全国范围内的计算机集群,但是由于它会占用很长的任务队列时间,两天之后请求就被拒绝了。” 他们继续说到,在Windows Azure 上只花了三天时间就完成了所有的计算。

Windows Azure 能够运行三种不同版本的 BLAST,BlastP、BlastN 和 BlastX。 BlastP 是用于在蛋白质数据库中搜索类似序列的。 BlastN 会对 DNA 序列做相同的工作。 BlastX 是用于比较 DNA 序列和蛋白质序列数据库的概念性转换的。 所有三种应用程序都可以不需改变就运行在 Windows Azure 上。 此外,还需要专注于用户界面的 web 角色,以及在 BLAST 应用程序的各个分离实例中分配工作的 worker 角色。

Windows Azure 上的 NCBI BLAST 已经通过微软的“全球云研究协作计划 (Global Cloud Research Engagement Initiative)”免费提供给很多位研究员。 这个项目也被叫做“ Azure 参与研究项目(Azure Research Engagement Project)”。

查看英文原文: NCBI BLAST for Windows Azure

2010-12-18 00:55945
用户头像

发布了 340 篇内容, 共 126.2 次阅读, 收获喜欢 13 次。

关注

评论

发布
暂无评论
发现更多内容

【源码解析】MyBatis动态SQL

小明Java问道之路

源码分析 mybaits 8月月更

开源一夏 |如何优化线上服务器

叶秋学长

开源 服务器 8月月更

东西向和南北向通信的统一

阿泽🧸

8月月更

2022-Java后端工程师面试指南-(Elasticsearch)

自然

Elastic Search 8月月更

Vue是什么?Vue和jQuery

flow

8月月更

LeetCode第三题(Longest Substring Without Repeating Characters)三部曲之三:两次优化

程序员欣宸

Java LeetCode 8月月更

目标检测的国内外研究现状

阿炜小菜鸡

目标检测 8月月更

目标检测技术研究现状及发展趋势

阿炜小菜鸡

目标检测 8月月更

FinClip最易用的智能电视小程序

Geek_99967b

小程序

gulp

Jason199

js gulp 8月月更

带你造轮子,自定义一个随意拖拽可吸边的悬浮View组件

yechaoa

android 开源 签约计划第三季 8月月更

从0到1看支付

自然

支付系统 后端开发 支付网关 签约计划第三季

云计算国内外发展现状

阿炜小菜鸡

云计算 8月月更

6 个你必须明白 Vue3 的 ref 和 reactive 问题(入门篇)

pingan8787

JavaScript 前端开发 vuejs 8月月更

一文带你了解 Java 中的构造器

踏雪痕

Java 构造函数 8月月更

FinClip,车载小程序新玩法

Geek_99967b

小程序

现网设备兼容SRv6网络演进

穿过生命散发芬芳

8月月更 SRv6

2022-Java后端工程师必会知识点-(操作系统)

自然

操作系统 8月月更

SRE运维解密-什么是SRE:DevOps模型的具体实践!

董哥的黑板报

DevOps 运维 云原生 SRE Google

【CSS】设置文本样式,包括文本颜色、对齐、缩进、行高等

翼同学

CSS HTML5, CSS3 8月月更

AOSP CameraLatencyHistogram的原理与使用

桑榆

Android; 8月月更

【大厂面试真题解析】虾皮 Shopee 后端一面十四问

面试官问

面试 后端 面试题 Shopee 虾皮

FinClip,助长智能电视更多想象空间

Geek_99967b

小程序

第1章:初识数据库与MySQL----MySQL安装

乌龟哥哥

8月月更

系统管理-Linux系统文件查找

Albert Edison

Linux centos linux 文件权限控制 find 8月月更

golang写的存储引擎,基于b+树,mmap

Alber

Build QEMU RISC-V Linux

贾献华

8月月更

免费的公共WiFi不要乱连,遭中间人攻击了吧?

wljslmz

网络安全 签约计划第三季 8月月更 中间人攻击

互联网用户账号信息管理规定今起施行:必须严打账号买卖灰产

石头IT视角

电商秒杀系统

极客土豆

《The Google File System》新说

Joseph295

Windows Azure上的NCBI BLAST_.NET_Jonathan Allen_InfoQ精选文章